根据《劳动法》及相关规定，探亲假是劳动者依法享有的权益。而国务院因特殊情况延长假期，是对全体公民的临时安排。两者性质不同，但在实际操作中，可能出现重叠。在此情况下，劳动者与用人单位应沟通协商，视具体情况而定。如用人单位条件允许，可考虑适当调整或延长探亲假。但若无特殊理由，劳动者也应尊重用人单位的安排。

探亲假与国务院延长假期重叠时，劳动者与用人单位应通过沟通协商，根据实际情况灵活处理。用人单位可在条件允许的情况下，适当考虑劳动者的需求，而劳动者也应理解并尊重用人单位的决定，共同维护劳动关系的和谐稳定。